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절세 가이드(사업자)

제주 투자진흥지구 세제 혜택 - 법인세·취득세·재산세 감면율 총정리

by Budreaming 2026. 7. 6.

제주도- 하면 무엇이 생각나시나요?

저는 푸른 바다, 여행이 생각납니다. 그런데 제주에 투자를 쉽게 할 수 있도록 제주투자진흥지구를 설정하여 투자유치를 하는 제도가 있습니다. 제주 경제를 활성화하고자 하는 목적이죠. 그 내용에 대해서 좀더 자세히 알아보도록 하겠습니다. 

제주 투자

제주에 투자하는 기업이라면 놓치지 말아야 할 제도, 바로 '제주투자진흥지구'입니다. 법인세·소득세 감면부터 취득세·재산세·등록면허세 감면까지, 신청 자격과 감면율, 주의해야 할 추징 요건을 정리해 보았어요.

 

📅 2026년 기준 🏷 조세특례제한법·지방세특례제한법 반영

제주투자진흥지구란? - 제도 개요

제주투자진흥지구는 「제주특별자치도 설치 및 국제자유도시 조성을 위한 특별법」 제162조에 근거해 제주도지사가 지정하는 특별 구역으로, 관광·첨단산업 등 핵심 산업에 투자하는 내·외국인 기업에 세제 감면 등 다양한 인센티브를 제공하는 투자유치 제도입니다.

제주는 지리적 여건과 협소한 내수시장이라는 한계를 안고 있어, 이를 극복하고 신산업 투자를 유도하기 위해 이 제도가 마련되었습니다. 지구로 지정되면 입주 기업은 법인세·소득세 같은 국세 감면과 취득세·재산세·등록면허세 같은 지방세 감면을 동시에 받을 수 있다는 점이 가장 큰 특징입니다.

제주투자진흥지구 핵심 혜택 유형

💰
법인세·소득세
최대 100% 감면
🏗
취득세
감면율 최대 85%
🏠
재산세
5년 면제 + 3년 50% 경감
📄
등록면허세
법인·부동산 등기 면제

세제 혜택 핵심 요약 한눈에 보기

100%
법인세 감면 (초기 3년)
관광·전략산업 기준
85%
취득세·재산세 감면율
제주도 조례 적용 시
2천만불
관광업 투자 기준
그 외 업종은 500만불
세목 감면 내용
법인세·소득세 최초 소득 발생 후 3년간 100%(개발사업시행자 50%),
이후 2년간 50%(개발사업시행자 25%)
취득세 사업용 부동산·선박 감면, 제주도 조례에 따라 감면율 최대 85%까지 확대 적용
재산세 직접 사용 부동산 5년간 면제 후 3년간 50% 경감
등록면허세 법인 설립 및 부동산 등기에 대한 등록면허세 면제
관세 감면대상사업에 사용할 수입물품에 대한 관세 면제(요건 충족 시)

💡 국세와 지방세 감면이 함께 적용됩니다.

법인세·소득세는 국세청, 취득세·재산세는 제주도청 소관으로 신청 절차와 감면 근거 법령이 다르니 각각 확인이 필요합니다.

신청 자격 — 투자금액 기준 확인하기

제주투자진흥지구 지정 및 세제 혜택을 받으려면 업종별로 정해진 최소 투자금액 기준을 충족해야 합니다. 「제주특별법」 시행령에 따라 투자사업비에는 토지매입비, 공사비, 설계비, 장비구입비 등이 포함됩니다.

업종별 투자금액 기준 체크리스트

관광 관련 사업 — 관광호텔업, 전문·종합휴양업(휴양콘도미니엄·골프장 제외), 국제회의시설업 등은 미화 2천만 달러 이상 투자
그 외 사업 — 첨단산업, 지식산업 등은 미화 500만 달러 이상 투자
제주특별자치도 소재 사업장에서 감면대상사업을 직접 수행할 것
도지사의 지구 지정 절차(신청 → 의견수렴 → 심의 → 고시)를 거쳐 정식 지정받을 것

⚠️ 법인세 감면 입주기한 확인 필수

 「조세특례제한법」 제121조의9는 제주투자진흥지구 입주기업의 법인세·소득세 감면 적용기한을 두고 있으며, 이 기한은 세법 개정을 통해 매년 연장 여부가 결정됩니다. 신청 전 국세청 또는 세무 전문가를 통해 현재 시점의 정확한 적용기한을 반드시 확인하세요.

법인세·소득세 감면율 상세

「조세특례제한법」 제121조의9는 제주투자진흥지구 입주기업의 감면대상사업에서 발생한 소득에 대해 단계적으로 법인세 또는 소득세를 감면하도록 규정합니다.

감면 대상 사업 구분

감면 혜택은 ① 제주투자진흥지구에 입주하는 기업이 지구 내 사업장에서 하는 사업, ② 제주자유무역지역 입주기업의 사업, ③ 지구 개발사업시행자의 개발사업 세 가지로 나뉘며, 유형에 따라 감면율이 다르게 적용됩니다.

연차별 감면율

구분 최초 3년 다음 2년
입주기업 사업 (①·②) 100% 감면 50% 감면
개발사업시행자 (③) 50% 감면 25% 감면

감면 기산일은 사업개시 후 감면대상사업에서 최초로 소득이 발생한 과세연도이며, 사업개시일로부터 5년이 되는 날까지 소득이 발생하지 않으면 5년이 되는 해를 기준으로 감면 기간을 계산해야해요. 상시근로자 수 유지 여부에 따라 추가 감면·추징이 달라질 수 있어 고용 유지 계획도 함께 점검하는 것이 좋습니다.

취득세·재산세·등록면허세 감면

지방세 감면은 「지방세특례제한법」 제78조의3과 제주특별자치도세 감면 조례에 근거합니다. 제주도는 조례를 통해 법정 감면율보다 높은 수준의 우대 감면을 적용하고 있는 것이 특징입니다.

취득세 · 등록면허세

감면목적사업에 직접 사용하기 위한 사업용 부동산·선박을 취득하는 경우 취득세가 감면되며, 법인 설립 및 부동산 등기에 대한 등록면허세도 함께 면제됩니다. 특히 제주도 조례는 「지방세특례제한법」상 감면기간·감면율을 확대 적용해, 감면율을 100분의 85(85%) 수준까지 상향하고 있어요.

재산세

감면목적사업에 직접 사용하는 부동산에 대해서는 5년간 재산세가 면제되고, 이후 3년간 50%가 추가로 경감됩니다. 수도권 소재 기업이 제주로 이전하는 경우에도 유사한 취득세·재산세 감면 체계가 적용됩니다.

실무 팁

 지방세 감면율과 기간은 제주도 조례 개정에 따라 달라질 수 있으므로, 실제 신청 전에는 제주특별자치도 세정 담당 부서(064-710-3375)를 통해 최신 감면율을 확인하는 것이 안전해요. 꼭 기억하세요!

감면 추징 요건 — 이것만은 조심하세요

세제 혜택은 조건부로 주어지는 만큼, 아래 사유에 해당하면 이미 감면받은 세액이 다시 추징될 수 있으니 조심해야해요.

지구 지정일(또는 입주기업의 경우 부동산 취득·입주일 중 빠른 날)로부터 3년 이내에 정당한 사유 없이 감면목적사업에 사용하지 않고 매각·증여하거나 다른 용도로 사용하는 경우
지구 지정 이후 취득한 부동산·선박을 취득일로부터 1년 이내에 감면목적사업에 사용하지 않는 경우
사용 개시 후 2년 이상 감면목적사업에 사용하지 않고 매각·증여하거나 다른 용도로 전환하는 경우
지구 지정 해제, 입주 허가 취소, 폐업 시 감면된 취득세·재산세가 추징될 수 있음

🚨 고용 유지 조건 주의 

청년 고용 등 상시근로자 수 요건을 적용받아 감면받은 경우, 감면 과세연도 종료일부터 2년 이내 각 과세연도의 상시근로자 수가 감소하면 감면세액에 상당하는 금액을 다시 납부해야 할 수 있답니다.감면을 받을 경우는 항상, 사후관리가 필요하다는 사실!

지정 절차 타임라인

 
 
1단계
지정 신청
조례 서식에 따라 도지사에게 지구 지정 신청서 제출
 
 
2단계
의견수렴 및 투자능력 조사
행정시장 및 관계전문가 2인 이상 의견수렴, 투자자 신용도 등 투자능력 조사(60일 이내 검토결과 통보)
 
 
3단계
지정계획 수립 및 주민열람
지정계획(안) 도보·인터넷 공고 후 14일간 주민열람 진행
 
 
4단계
종합계획심의위원회 심의
투자 실행 가능성, 고용 증대 효과, 지역업체 참여계획, 지역사회 상생방안 등을 종합 심의
 
5단계
지구 지정 고시
제주특별자치도 고시를 통해 명칭·위치·면적·개발 및 관리방법·주요사업내용 확정

2026년 확인해야 할 변경 포인트

제주투자진흥지구 세제 혜택은 매년 세법 개정과 제주도 조례 개정의 영향을 받는 제도예요. 2026년 투자를 계획 중이라면 아래 두 가지를 특히 눈여겨봐야 합니다.

포인트 ① 법인세 감면 적용기한 확인

「조세특례제한법」 제121조의9에 명시된 법인세·소득세 감면 적용기한은 그간 세법 개정을 통해 반복적으로 연장되어 왔어요. 투자 실행 시점 기준으로 해당 조항의 최신 개정 내용을 국세법령정보시스템 또는 세무 전문가를 통해 반드시 재확인해야 실제로 감면을 받을 수 있는지 판단할 수 있습니다.

포인트 ② 투자진흥지구 내 융자지원 확대

제주도는 2026년 관광진흥기금 융자지원 개편을 통해, 세제 혜택이 이미 종료되고 투자계획 이행을 완료한 투자진흥지구 내 사업체도 시설·경영안정자금 융자지원 대상에 새로 포함시켰습니다. 세제 혜택 기간이 끝난 이후에도 별도의 금융 지원 경로가 열려 있다는 점을 함께 참고하면 좋습니다.

구분 확인 방법         
법인세·소득세 감면기한 국세법령정보시스템, 관할 세무서 또는 세무 전문가 상담
취득세·재산세 감면율 제주특별자치도 세정 담당 부서(064-710-3375)
지구 지정 및 투자 절차 제주특별자치도청 경제활력국 기업투자과
투자 전 반드시 확인하세요             

제주투자진흥지구 세제 혜택, 신청 전 전문가 상담이 먼저입니다

법인세·소득세 감면 적용기한과 지방세 감면율은 법령·조례 개정에 따라 수시로 달라질 수 있습니다. 실제 투자를 진행하기 전, 제주특별자치도 담당 부서와 세무 전문가를 통해 최신 기준을 함께 확인하세요.      

                              

 
국세: 법인세·소득세 최대 100% 감면(초기 3년 기준)
 
지방세: 취득세·재산세 감면율 최대 85%, 재산세 5년 면제
 
투자기준: 관광업 2천만불, 그 외 업종 500만불 이상

위의 내용을 바탕으로, 무엇인가를 시작하려고 하신다면

반드시! 무조건! 관련 법령 및 관계기관에 사전 확인을 하셔야합니다.

돌다리도 두들겨가라! 라는 말도 있잖아요!! ^^

 

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본 글은 2026년 7월 기준 「조세특례제한법」, 「지방세특례제한법」 및 제주특별자치도 관련 공고를 참고해 작성되었습니다. 세율·감면 기간·적용 요건은 법령 및 조례 개정에 따라 달라질 수 있으므로, 실제 신청 및 세무 처리 전에는 반드시 관할 기관 또는 세무 전문가의 확인을 거치시기 바랍니다.